اعتبر التنظيم الشعبي الناصري أن الخطوات المتسارعة التي تقوم بها اسرائيل من أجل تهويد القدس باتت تشكل خطراً داهماً على مصير المدينة المقدسة، وعلى وجود سكانها الفلسطينيين المتروكين وحدهم في مواجهة المستوطنين وآلة البطش الصهيونية. وأدان التنظيم الصمت المطبق عربياً ودولياً حول ما يجري في القدس، ودعا إلى إعادة الاعتبار لخيار المقاومة كأسلوب وحيد لإنقاذ القدس والضفة الغربية وسائر الأرض الفلسطينية. هذا الكلام ورد في بيان أصدره التنظيم لمناسبة يوم القدس العالمي، وأضاف التنظيم في بيانه:

"إن استعادة الوحدة الوطنية الفلسطينية على قاعدة خيار المقاومة تمثل خطوة أساسية لا بد منها من أجل الحد من الاختلال في ميزان القوى لمصلحة اسرائيل، وهي تمثل أيضاً البديل عن مسلسل المفاوضات العبثية التي تتحكم بمسارها الولايات المتحدة الحليف الستراتيجي للعدو الصهيوني."
وأدان التنظيم مواقف النظام الرسمي العربي الذي تخلى عن القدس وفلسطين، وكرس كل جهوده وموارده لتسعير القتال في سوريا، ولإذكاء نار الفتنة المذهبية في البلدان العربية. كما أدان أسلوب النفاق الذي يعتمده المجتمع الدولي، ودعواته الجوفاء إلى الحرية والديمقراطية وحقوق الإنسان، بينما هو يبقى صامتاً تجاه الممارسات العنصرية القمعية للصهاينة بحق الفلسطينيين، وتجاه انتهاكاتهم المتواصلة للحقوق البديهية للشعب الفلسطيني.
وخلص بيان التنظيم إلى التشديد على الالتزام بخيار المقاومة لمواجهة العدوانية الصهيونية
في فلسطين، وفي لبنان، وفي كل أرض عربية محتلة، معتبراً أن انتصار المقاومة على العدوان الصهيوني في حرب تموز 2006 هو خير دليل على صواب النهج المقاوم وفعاليته.